創薬機構は生命現象の解明や難病の克服など、国民の健康増進に貢献することを目指し、東京大学大学院薬学系研究科の附属組織として、創薬シーズ探索研究などで支援が必要な方々に総合的な支援*をしています。目的の活性化合物を探索されたい研究者に対しては、本邦最大の公的化合物ライブラリーからの化合物サンプルや必要となるスクリーニング技術や設備を提供しています。また、発見された活性化合物から、より好ましい活性と物性や体内動態を示す化合物への合成支援を機構内に設置した「構造展開ユニット」が担当しています。

* 日本医療研究開発機構（AMED）の生命科学・創薬研究支援基盤事業（BINDS）への参画を通じ、必要に応じBINDS内の​他のユニットや外部の研究機関と連携の上、企業創薬のノウハウを活用して、アカデミア発の創薬シーズの医薬品としての実用化を​目指した支援を提供しています。​